Déchets, Sciences & Techniques

N° 44


Evaluation de l’efficacité de trois méthodes d’extraction d’ADN de la biomasse microbienne totale du compost


L. Ben Ayed, A. Hassen, M. Gtari, N. Jedidi, N. Saidi, L. Jaoua et F. Murano

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Résumé

L’extraction des acides nucléiques à partir du compost permet de détecter des microorganismes non détectables par les méthodes classiques. En effet, nous avons essayé trois méthodes différentes et nous avons remarqué l’importance d’une bonne lyse cellulaire pour la libération de l’ADN (8 cycles de congélation-décongélation). L’utilisation du mélange CTABPVPP a été remarquable puisque ce dernier a permis d’éliminer des impuretés, ce qui s’est traduit par un éclaircissement des échantillons bruns originels. La méthode de purification la plus efficace est celle qui utilise le mélange PEG-NaCl

Abstract

DNA extraction from compost make easy the detection of microorganisms non discernable by classic and usual methods. In fact, we have examined three different methods and try to perform them. So, we found an important level of cell lysis by the freezing thawing cycles, we found also the important elimination of impurities by CTAB-PVPP, it is shown by a clarification of the samples. The mix PEG-NaCl made a good purification of the DNA.

Pour citer ce document

Référence papier : L. Ben Ayed, A. Hassen, M. Gtari, N. Jedidi, N. Saidi, L. Jaoua et F. Murano « Evaluation de l’efficacité de trois méthodes d’extraction d’ADN de la biomasse microbienne totale du compost », Dechets sciences et techniques, N° 44, 2006, p. 14-21.

Référence électronique : L. Ben Ayed, A. Hassen, M. Gtari, N. Jedidi, N. Saidi, L. Jaoua et F. Murano « Evaluation de l’efficacité de trois méthodes d’extraction d’ADN de la biomasse microbienne totale du compost », Dechets sciences et techniques [En ligne], N° 44, mis à jour le : 20/03/2015, URL : http://lodel.irevues.inist.fr/dechets-sciences-techniques/index.php?id=104, https://doi.org/10.4267/dechets-sciences-techniques.104

Auteur(s)

L. Ben Ayed

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

A. Hassen

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

M. Gtari

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

N. Jedidi

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

N. Saidi

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

L. Jaoua

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie

F. Murano

Institut national de la recherche scientifique et technique BP 95-2050, Hammam Lif, Tunisie